MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus erythropolis PR4 plasmid pREC1

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007486	AGC	2	6	22	27	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007486	GGA	2	6	476	481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007486	ACC	2	6	727	732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_007486	CCG	2	6	1459	1464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_007486	GTC	2	6	2836	2841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007486	TCCC	2	8	3148	3155	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_007486	GCT	2	6	3163	3168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007486	CGG	2	6	3178	3183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007486	CTATT	2	10	3225	3234	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007486	GTG	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007486	AGA	2	6	3276	3281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007486	AGGG	2	8	3288	3295	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007486	AG	3	6	4302	4307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007486	GTA	2	6	4588	4593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007486	GAG	2	6	4653	4658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007486	GAA	2	6	4706	4711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007486	GAA	2	6	5444	5449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007486	GCAGC	2	10	5489	5498	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_007486	GC	3	6	5497	5502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007486	CCG	2	6	5532	5537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_007486	CGA	2	6	5620	5625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007486	ACCG	2	8	14473	14480	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007486	AAC	2	6	16364	16369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_007486	CA	3	6	16380	16385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007486	TTG	2	6	16995	17000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007486	CCT	2	6	17690	17695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_007486	GGT	2	6	17696	17701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007486	CAAG	2	8	17702	17709	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_007486	CAAA	2	8	17841	17848	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007486	AC	3	6	17854	17859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007486	GCC	2	6	24346	24351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_007486	GGC	2	6	24362	24367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007486	CCGA	2	8	24400	24407	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_007486	TCC	2	6	24594	24599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_007486	GAA	2	6	24627	24632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007486	ATG	2	6	24691	24696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007486	TCG	2	6	27690	27695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007486	GTAA	2	8	27709	27716	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007486	AACG	2	8	27757	27764	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007486	TG	3	6	27773	27778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007486	C	6	6	27785	27790	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_007486	CGAC	2	8	27824	27831	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_007486	GCC	2	6	27855	27860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_007486	GCC	2	6	27864	27869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_007486	CT	3	6	27905	27910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007486	GCA	2	6	27955	27960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007486	CCG	2	6	27970	27975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_007486	TCC	2	6	27993	27998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_007486	GCG	2	6	28015	28020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007486	GCG	2	6	28624	28629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007486	ATC	2	6	28684	28689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007486	GAG	2	6	29312	29317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007486	TCG	2	6	30155	30160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_007486	CCG	2	6	30203	30208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_007486	CGG	2	6	30226	30231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_007486	CTG	2	6	30232	30237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007486	GGA	2	6	34360	34365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007486	GTG	2	6	39381	39386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007486	GGT	2	6	39389	39394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007486	TG	3	6	43301	43306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007486	TAG	2	6	47172	47177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007486	AATAG	2	10	47186	47195	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007486	TCA	2	6	48758	48763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007486	C	6	6	48766	48771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NC_007486	GAT	2	6	48773	48778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007486	GCG	2	6	48855	48860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007486	CCG	2	6	48909	48914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_007486	CCA	2	6	48940	48945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_007486	CGA	2	6	49736	49741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007486	ATC	2	6	49783	49788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007486	AGGT	2	8	49819	49826	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007486	AGC	2	6	49834	49839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_007486	GTG	2	6	49840	49845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007486	CCG	2	6	49853	49858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_007486	GGT	2	6	49978	49983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007486	CGGG	2	8	50000	50007	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_007486	TCC	2	6	53084	53089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_007486	GCC	2	6	55634	55639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_007486	CGC	2	6	55648	55653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_007486	GC	3	6	55706	55711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_007486	TCC	2	6	55713	55718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_007486	GAC	2	6	55779	55784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007486	CGG	2	6	55947	55952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007486	CTT	2	6	55979	55984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007486	GAA	2	6	56090	56095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007486	CA	3	6	56123	56128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_007486	ACG	2	6	56192	56197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007486	CT	3	6	56239	56244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_007486	CGC	2	6	56398	56403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_007486	GCC	2	6	56543	56548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_007486	ACG	2	6	56564	56569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007486	TG	3	6	56622	56627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007486	GCGTCA	2	12	56721	56732	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007486	CTTCC	2	10	56744	56753	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
95	NC_007486	TCACCG	2	12	56758	56769	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007486	TTC	2	6	56776	56781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007486	G	6	6	56792	56797	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007486	GGC	2	6	56850	56855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007486	CAT	2	6	57396	57401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007486	T	6	6	57417	57422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007486	ACCG	2	8	57480	57487	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007486	CGC	2	6	57513	57518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_007486	CAC	3	9	57561	57569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007486	GTTT	2	8	57580	57587	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007486	GTAC	2	8	57590	57597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_007486	GGC	2	6	59363	59368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007486	CGC	2	6	59387	59392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_007486	GCCC	2	8	59401	59408	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_007486	TGG	2	6	59477	59482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007486	CTT	2	6	59627	59632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007486	TCG	2	6	59644	59649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007486	CTG	2	6	59656	59661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007486	CAG	2	6	59664	59669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_007486	AGC	2	6	59677	59682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007486	GAA	2	6	59685	59690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007486	GGA	2	6	59693	59698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007486	GCTA	2	8	59757	59764	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_007486	GACA	2	8	59765	59772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007486	CTCA	2	8	59835	59842	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007486	TGC	2	6	59853	59858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007486	TGA	2	6	59910	59915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007486	AAT	2	6	59922	59927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007486	CA	3	6	59959	59964	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_007486	AGT	2	6	59989	59994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007486	AAG	2	6	62904	62909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007486	CAG	2	6	62932	62937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_007486	GA	3	6	63628	63633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007486	CTGT	2	8	63657	63664	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_007486	GACG	2	8	63708	63715	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_007486	CAC	2	6	63786	63791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_007486	CG	3	6	63839	63844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007486	TTGA	2	8	63845	63852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007486	TTTC	2	8	63855	63862	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_007486	GAT	2	6	63874	63879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007486	GGT	2	6	63893	63898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007486	CAAC	2	8	63901	63908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_007486	GC	3	6	63992	63997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007486	AGGT	2	8	64004	64011	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007486	CCTCG	2	10	64018	64027	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_007486	GGTA	2	8	64041	64048	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007486	CTAG	2	8	65258	65265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_007486	GTA	2	6	65268	65273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007486	CAAA	2	8	65307	65314	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_007486	CCG	2	6	65324	65329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_007486	GTC	2	6	67360	67365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_007486	GCGT	2	8	68540	68547	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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148	NC_007486	CGG	2	6	68569	68574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NC_007486	GC	3	6	68646	68651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_007486	CGT	2	6	68692	68697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_007486	GTC	2	6	68725	68730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_007486	CGG	2	6	70288	70293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_007486	GTG	2	6	73565	73570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.